機械学習モデルの効率化
Trainer Engineは、学習～モデルの共有のライフサイクルをシンプル化することで、生物活性や物理化学的特性の予測を、組織規模で効率的に機械学習の取り組みのルーチン化を可能にします。
新機能と改善点 Ver.3.1
自動モデル構築画面にハイパーパラメーターの最適化度を調整する為のスライダーが追加されました。こちらから実行時間と構築モデル数を制御できるようになります。
オープンソースのDeepChem
高精度の予測モデルを構築・展開
分子の生物学的活性や物理化学的特性は、その分子の化学構造式に暗号化化されてるようなものです。分子の計測データを収集・管理・機械学習することによって、隠された化学構造と活性値などと関係性を見出すことできます。
機能のカバレッジ
データの取り込み~検証済みモデルの組織内展開まで
聡明
構造式の標準化と高品質でカスタマイズ可能な記述子を利用
利便性
モデル最適化のための豊富なフィードバックと可視化
再現性
セントラルモデルリポジトリで採用モデルの選定を支援
統合
内蔵のグラフィカルインターフェース、Design Hub 、
その他のデザインプラットフォームから
予測機能にアクセス可能
予測
生物活性、ADMET、物理化学的性質の予測が可能
各種機械学習アルゴリズムに対応
Trainer Engineは化学データを自動的に正規化して高性能な記述子を生成できます。
ランダムフォレスト、勾配ブースティング、サポートベクターマシン、ロジスティック回帰 を含めた広範な機械学習アルゴリズムを提供します。モデルの性能は自動的に評価され、最も重要な統計パラメータは回帰と分類の両方のケースで計算されます。ランダムフォレストの場合、特徴選択は特徴の重要性に基づくシームレスな再トレーニングによってサポートされます。校正された誤差は、コンフォーマル予測フレームワークを使用して計算されます。学習セットから最も類似した構造とそれに対応するアクティビティデータを返すことで、適用領域評価を可能にしています。
可視化
生成されたモデルのコレクションは、予測能力を評価し、その挙動に関する洞察を提供するために、セントラルサービスからアクセス可能です。Trainer Engineはモデルをリポジトリに保存することで、再現性を確保し、便利にパラメータを比較することができます。設定可能な分析ビューには、最適化されたテーブル、チャート、分子可視化機能を備えた分類および回帰レイアウトのプリセットが用意されています。
使用方法
シングル/バッチモード
Trainer EngineはSDFファイルアップロードによるシングルまたはバッチモードにて新規予測のためのサービスを提供します。
REST API
プログラムによるアクセスでは、機械学習ワークフローの自動化と
Design Hub などの設計ツールや他のアプリケーションへの予測の統合のため、REST APIインターフェースの利用を推奨します。
モデル構築のための最適化
Trainer Engineグラフィカルユーザーインターフェースは、モデルの構築・検証・比較のための豊富なツール群を提供します。これは計算化学者に愛用されています。
シンプルな予測インターフェース
エンドユーザー向けに最適化された軽量な予測アプリケーション「Playground」が付属しています。
資料ダウンロード
資料にてより詳細をご覧いただけます。
Zosimosはインタラクティブな問題やチュートリアルの作成、答え合わせなどををオンライン上で実現し、化学や生化学の授業をより効果的にします。卓越したChemAxonの化学情報基盤をベースとしており、構造式や反応式、バイオ分子を含む問題を提示したり、生徒の答えを自動的に評価および採点します。
化学学習の為の仮想教室を提供
ChemAxonのZosimosプラットフォームでは、インタラクティブな化学クイズを作成できるため、時間
を節約できます。
学生をプライベートな学習グループに招待して、評価を割り当てることができます。
Zosimosは、ノートPCやタブレットからWebアプリケーションとして利用できます。
新しいZosimosの教育フレームワークは、オープンな学習コミュニティを提供し、コラボレーションを強化して学習の効果を高めます。
テスト、教室でのコラボレーション、学習進度の追跡に役立つ強力なツールを教師に提供します。
Zosimos - 新しい化学教育体験を詳しく見る
効果的なオンライン化学教育の為のウェビナー
本ウェビナーでは、Zosimosを使用して化学の授業を効果的にサポートする為の主な手順を紹介します。
仮想クラスのセットアップ インタラクティブなオンライン化学クイズと試験の作成 生徒とクイズや試験を共有する 生徒の結果を確認する 化学記憶ゲームでクラスに楽しいひねりを加える 他のオンライン教室ツールでZosimosを使用するオプションについても検討します。
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Future of Chemical Education 2021
Online Symposium Apr 14, 2021
Within the framework of the Spring Meeting of the Swiss Chemical Society the Division of Chemical Education organises a symposium for those involved in teaching chemistry at different levels such as Sek I, Sek II, Universities of Applied Sciences (FH) and Universities. The major objective of this symposium are the challenges related to teaching chemistry in the first year of the studies at the university.
Professors and teachers from all Swiss universities and also external speakers will share their view, experience, strategies and solutions gained and developed while dealing with the chemistry courses for a large body of students, who just recently left the high schools and commenced their studies at the university.
In this sense we would like to invite you to take part in Future of Chemical Education 2021, which will take place on April 14, 2021, as an online event.
Visit our booth featuring Zosimos at the conference website .
標準的な知識ベースでは、お客様が直面する特定の課題を解決できないことがよくあります。Excelra のシニアエキスパートとコンサルタントは、お客様の特定の問題を理解し、正確なニーズに応えるオーダーメイドのソリューションを提供します。 Excelra は非構造化データを抽出、構造化、整理し、高品質で分析に適した形式に変換する専門知識と経験を有しており、創薬における情報に基づいたデータ駆動型の意思決定を可能にします。 お客様のデータを扱う場合、10年以上にわたるトップクラスの製薬会社や科学出版社とのパートナーシップによって証明されるように、最高のデータプライバシーと機密保持基準を遵守しています。 品質に妥協することなく、短納期の仕事にも柔軟に対応します。
創薬を加速するキュレーションサービス
ニッチなターゲットに関するカスタムキュレーションサービスは、ターゲット情報、活性値を伴う化学構造、発明者の詳細などに関する包括的なアノテーションを提供することで、医薬化学者や計算科学者の探索範囲を効率的且つスピーディーに拡張します。
ニーズを熟知した専門家集団が対応
Excelraは豊富な経験を通し、世界中の製薬会社やバイオテクノロジー企業のデータ要件をよく理解し、業界で認められたオントロジーを持つデータセットを作成し、お客様のプラットフォーム、分析ツール、プロトコル、方法論にシームレスに統合することができます。雑誌論文、特許、その他の文書（レター＆レビュー、企業パイプライン、会議録）、およびお客様からご提供いただく独自情報源などから、お客様の要望に沿って、データを抽出・整理・標準化し、唯一無二の解析可能なデータセットを構築します。 データは、SDFやMRV、テキストファイル（TSV,CSV)、EXCELファイルなどの形式でご提供します。また、大規模なデータについてはORACLEなどのダンプファイルにてご提供いたします。
主な用途
ニッチなターゲットに関するカスタムデータベースの構築
競合会社の情報収集（特許のマーカッシュ構造を可視化）
AI/ML学習用データセットの構築
ターゲットおよび化合物クラス周辺の状況分析 ・ADMETデータセットの生成
Excelra社について
Excelra アドバンテージは、独自の精選されたデータ資産、深い専門知識、データサイエンスをシームレスに融合することで生まれます。当社の多面的なチームは、最先端のテクノロジーを駆使して、大量の異種非構造化データを調和させ、分析します。 データ主導の意思決定により、業務効率を高め、創薬開発のスピードアップを実現し、創薬と医薬品開発を加速させます。 過去18年間、Excelraは、大手製薬会社上位20社のうち15社を含む90社以上のグローバルクライアントから、データおよび分析のパートナーとして選ばれてきました。
Excelraは、500人以上の訓練を受けたデータキュレーター（それぞれが有資格の主題専門家）からなるチームを有しており、複雑なデータ状況を把握し、お客様の創薬ライフサイクルを加速させる化学、生物、医学データを提供することが可能です。
Excelra社は以下の提供が可能です
膨大な化学物質と構造活性相関を照らし出す、構造化された高品質なデータセット
AI-ML創薬モデルのための解析可能なデータセット
お客様の社内データとの統合、およびお客様のシステムとの互換性を考慮したデータセット
Markush構造から個別構造の生成、R-グループ解析解析、特定ターゲット周辺のランドスケープ解析、ADMETデータセット生成など、化学キュレーションのあらゆるニーズにお応えします。
より詳細な情報については、カタログ をご覧頂くか、直接お問い合わせ ください。
カタログはこちら
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GOSTARデータによるKRAS研究に関する資料はこちら。
Markush構造は、化合物クラスを一般的な表記で記述したもので、特許請求の範囲やコンビナトリアルライブラリによく使用されます。Excelra では、お客様の化学データベースのご要望にお応えし、スキャフォールドベースの研究をサポートするために、 お客様が指定する特許のマーカッシュクレームをChemaxonのマーカッシュ技術に基づく電子化を行うサービスです。
特許からカスタムマーカッシュデータベースを構築
MRV形式でMarkush構造を抽出し、ChemaxonのMarkush Enumereationによる個別構造の列挙やMarkush Editor での解析に利用可能な形式で提供
個別構造に展開せずに、Markush構造のままのデータベース化し、ChemaxonのMarkush Serch 技術が利用可能なデータセットを提供
Excelra アドバンテージは、独自の精選されたデータ資産、深い専門知識、データサイエンスをシームレスに融合することで生まれます。当社の多面的なチームは、最先端のテクノロジーを駆使して、大量の異種非構造化データを調和させ、分析します。 データ主導の意思決定により、業務効率を高め、創薬開発のスピードアップを実現し、創薬と医薬品開発を加速させます。 過去18年間、Excelraは、大手製薬会社上位20社のうち15社を含む90社以上のグローバルクライアントから、データおよび分析のパートナーとして選ばれてきました。
Excelraは、500人以上の訓練を受けたデータキュレーター（それぞれが有資格の主題専門家）からなるチームを有しており、複雑なデータ状況を把握し、お客様の創薬ライフサイクルを加速させる化学、生物、医学データを提供することが可能です。
膨大な化学物質と構造活性相関を照らし出す、構造化された高品質なデータセット
AI-ML創薬モデルのための解析可能なデータセット
お客様の社内データとの統合、およびお客様のシステムとの互換性を考慮したデータセット
Markush構造から個別構造の生成、R-グループ解析解析、特定ターゲット周辺のランドスケープ解析、ADMETデータセット生成など、化学キュレーションのあらゆるニーズにお応えします。
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【NEW】皮膚等障害化学物質に対応
労働安全衛生規則第594条の２に基づく化学防護手袋・保護具の着用義務物質を特定
2024年4月1日に施行される労働安全衛生法改正により、皮膚等障害化学物質等に対して、化学防護手袋等の保護具着用が義務化されます。
CRAIS Checkerを用いるとこれらの皮膚等障害化学物質を構造式などから容易に特定可能できるようになり、裾切値なども確認できます。
CRAIS Checkerと連携して電子実験ノート自動チェックを行ったり、在庫管理システムと連携して分類・ラベル表示等を行うことで、保護具の着用喚起を行えます。
コンプライアンス対応をより確実に、効率的に
法規制物質チェックシステムCRAIS Checkerは構造式から麻薬や指定薬物、毒物、劇物等の法規制を確認することができるシステムです。 今日、法令等の遵守は重要な経営課題の一つとなっております。万一法令に違反した場合、刑事罰や行政制裁に加え、企業イメージの悪化や売上の落ち込みなど、経営に大きな影響を及ぼす可能性があります。化合物を取り扱う企業において、規制化合物を適正に取り扱う事はコンプライアンスの観点から非常に重要ですが、規制化合物は多種多様であり、各組織において化合物を取り扱う全ての人が全ての規制化合物を把握する事は現実的ではありません。 CRAIS Checkerはこのような問題を解決するソフトウェアです。CRAIS Checkerでは規制法令に該当する構造が簡単に特定できますので、組織内での化合物の適正管理を推進することができます。
対応法規制等
以下の法規制等のうち、化学構造式から識別可能な低分子化合物を対象に対応しています。
法令等
詳細
健康被害
覚せい剤取締法
覚せい剤、覚せい剤原料
麻薬及び向精神薬取締法、大麻取締法、あへん法
麻薬、向精神薬、麻薬向精神薬原料、大麻、あへん、けしがら
医薬品、医療機器等の品質、有効性及び安全性の確保等に関する法律（薬機法）
指定薬物、毒薬、劇薬、放射性医薬品、習慣性医薬品、日本薬局方【NEW!】
毒物及び劇物取締法
特定毒物、毒物、劇物
知事指定薬物
東京都、大阪府、神奈川県、茨城県、栃木県
放射性同位元素等の規制に関する法律
放射性同位元素
労働環境
労働安全衛生法
55条（製造等禁止）【リスクアセスメント対象物】 【リスクアセスメント対象物】
危険物（労働安全衛生法施行令 別表第一）
作業記録等の30年間保存が必要ながん原性物質
労働安全衛生規則第五百七十七条の二第二項の規定に基づき厚生労働大臣が定める物及び厚生労働大臣が定める濃度の基準
皮膚等障害化学物質【NEW!】
安全保障
化学兵器禁止法（化兵法）
特定物質、第一種指定物質、第二種指定物質
輸出貿易管理令
別表第一、別表第二
原子力基本法
核燃料、核原料
環境保護
化学物質排出把握管理促進法（化管法）
第一種指定化学物質（PRTR制度、SDS制度）、特定第一種指定化学物質（発がん性）、第二種指定化学物質（SDS制度）
化学物質の審査及び製造等の規制に関する法律（化審法）
第一種特定化学物質、第二種特定化学物質、監視化学物質
水質汚濁防止法
カドミウム等の物質
土壌汚染対策法
第二条第一項 特定有害物質
悪臭防止法
第二条第一項 特定悪臭物質
オゾン層を破壊する物質に関するモントリオール議定書
付属書CグループI、付属書CグループI以外
農薬取締法
販売禁止農薬
PCB特措法
ポリ塩化ビフェニル廃棄物の適正な処理の推進に関する特別措置法
ダイオキシン類対策特別措置法
ダイオキシン類対策特別措置法施行規則 別表第三
ロッテルダム条約
付属書IIIに揚げる物質
航空法
航空機による爆発物等の輸送基準等
危険
物
国際連合危険物輸送勧告
United Nations Recommendations on the Transport of Dangerous Goods
火薬取締法
火薬類
消防法危険物
第一類（酸化性固体）
海外法令等
米国 Controlled Substance Act
Schedule I~V
欧州REACH規則
高懸念物質/SVHC
IARCによる発がん性の分類
グループ1、2A、2B、3
※ 法令等の改正時には規制データベースのアップデートを行います。またお客様からのご要望に基づき計画的に対応令等を拡張しております。
※ 海外の法令については、別製品「Compliance Checker」で対応しています。
CRAIS Checkerの特長
高精度・高速な判定アルゴリズム
規制構造を漏らさずチェックし、ノイズ（誤判定）を極小化しています
確実で効率的なコンプライアンス体制を構築できます
電子実験ノートや試薬管理システムなどと連携し、利用者に負担をかけずに自動的且つ強制的にチェックが行われ、記録されます
あらかじめ設定した条件に該当する場合は担当者に電子メールが送信されます
世界で認められた有用性
世界のメガファーマと関連ベンダーが集い業界共通の課題解決に取り組んでいる）Pistoia Allianceの法規制対応プロジェクト（CSCS にCRAIS Checkerをベースとした提案が選定されました。現在Pistoia Allianceの要件を反映した海外版の法規制チェックシステムCompliance Checkerとして海外向けに販売しています。
充実した規制データベース
広範な法規制をサポートしており、スピーディーに法改正に対応します
お客様からのご要望に基づき計画的に対応法令を拡張しています
CAS 登録番号 (CAS RN ® ) ライセンスプログラムに参加の上、CAS登録番号を提供しています。（全ての規制物質にCAS登録番号が提供されているわけではありません。）
試薬管理システムCRAIS Reagentとのシームレスな連係
キット品管理など最新の薬品管理機能を有するシステムで、CRAIS Checkerと連動し、在庫試薬や試薬カタログの法規制チェックが行えます。法改正などへの対応はより確実・簡単に行えます
外部システムとの連携
SOA（サービス指向アーキテクチャ）の採用により、電子実験ノートや試薬管理システム等の外部システムとの連携が容易です。例えば電子ノートとの連携では、合成計画立案時点で規制化合物か否かのチェックを自動化することが可能です。これまでに主要なベンダー4社が提供する５種類の電子実験ノート との連係実績があります。
チェックする法令を選択可能
例えば電子ノートからの問い合わせには劇物を含まない、試薬管理システムからの問い合わせは劇物をチェックする、などのように業務によってチェックする法令が選択できます
資料ダウンロード
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薬品管理のコンプライアンス対応をより確実、簡単に
今日、化学物質の取扱いに関して、様々な法規制へのコンプライアンス対応が求められています。しかしながら、現実にはしばしば改正される法規制へのタイムリーな対応や、生物系試薬、キット品などへの厳密な対応は容易ではありませんでした。
CRAIS Reagentは、試薬情報や在庫情報に対し、メーカーカタログや商用試薬データベース、法規制物質チェックシステムCRAIS Checkerと連携し、最新の法規制情報を容易に管理することができます。
これにより、CRAIS Reagentを用いれば、正確な法規制情報に基づく試薬管理を行うことが出来ます。また、これらの法令情報は、システム上でわかりやすく表示がおこなわ れますので、試薬の取扱者全員が法規制情報をより把握し易くなり、コンプライアンス対応や、研究環境の安全性向上が促進されます。
特長
毒物、指定薬物、麻薬・向精神薬等の厳重な管理が求められる試薬に関して、使用量記録の強制等、管理方法の指定が可能です。
電子保管庫や鍵ボックスを使用する事により、保管庫の開閉履歴が自動で収集出来ます。（オプション）
試薬や商品マスターに購入禁止の設定を行う事で、企業ポリシーにより購入を禁止している試薬の購入を防止できます。
期末在庫やPRTRの集計が瞬時に行えます。
最新のWebアプリ技術を利用し、抜群の使い勝手
正確且つ、詳細な構造検索が可能
ハンディーターミナルの利用
電子実験ノート、外部購買サイト、ERPなどの外部システムとの連携
－ ハードウエア構成例：
鍵ボックス、電子保管庫との連携も可能です。危険物保管庫等電源の無い場所ではハンディーターミナルによる操作が行えます。
実態に則した、危険物管理（消防法）
保管場所毎に管理が可能
登録時、移動時等に随時指定数量チェックが可能
適用外の部屋に対して部屋全体の指定数量値を設定する事が可能
小量危険物倉庫・危険物倉庫に対しては消防法分類毎の指定数量値を設定する事が可能
資料ダウンロード
CRAIS ReagentのPDF資料は、下記「DOWNLOAD」ボタンをクリックしてiPROSからダウンロードをお願いします。
試験依頼に係る悩みのアレコレ、解決します。
年々増えていく化合物、複雑化・多様化する試験、試験状況の確認等試験に関するその他業務など、科学者や研究者の皆様を取り巻く環境はますます煩雑化しています。
Quick Requestは、試験に関する様々な課題を抱えるお客様のご要望を実現したシステムです。主にDMTAサイクルのT（テスト）部分をサポートし、抱えている試験を視覚的に見やすく示すだけでなく、依頼部門と試験部門の連絡手段を集約することにより、連絡・連係ミスを防ぎ、試験の更なる効率化を図ります。
試験を効率化する多数機能を搭載
ワークフローのサポート
本システムの根幹となる、ワークフローのサポート機能があります。試験ごとに設定可能です。以下のように試験依頼のサポートをします。
依頼化合物の登録： 自社化合物DBシステム、テキストファイル、Design Hubから登録可能依頼： 希望する化合物（及びロット）と試験、優先度を指定して依頼承認： 上長や試験管理者からの承認、コメント付きでの差し戻し時に依頼者へメール通知受付： 受付担当者による受付、コメント付きでの差し戻し時に依頼者へメール通知完了： 試験値が登録された後、完了ステータスに更新（試験値データベースとの連携が必要）
細かな権限設定
本システムでは、社内運用に合わせ「ロール」という単位を各ユーザーに付与することで様々な権限の設定ができます。例えば、ユーザーごとの権限の設定、プロジェクト毎のアクセス権限など社内・プロジェクト等に合わせた権限設定が可能です。こういった設定が不要である場合には、全ての権限を未設定にしても運用いただけるような仕様になっていますので、多様なユーザーニーズに対応できます。
試験状況の可視化
システムのトップページに、試験を一覧表示しており、依頼状況も可視化されています。承認待ち、試験受付待ち、キャンセル等のステータスでそれぞれの状況を表します。
その他特長
各化合物に関する試験履歴の保持
「依頼者」「承認者」「受付者」へのメール・コメント送信
各種マスター（コメントマスター、試験タイプなど）管理
優先度の設定
重複試験のチェック警告
試験に必要な最低試験量が指定されている場合の警告
試験項目の文字列部分一致検索
複数試験項目をまとめて依頼するセット機能
ファイル（Excel、タブやカンマ区切りテキストファイル）や別システムからの化合物登録機能
オプションについて
Chemaxon社『Design Hub』との連携
オプションとして、弊社が総代理店として提供しているChemaxon 社製品のDesign Hub との連携が可能です。Design Hubとは、「仮説駆動型」及び「データ駆動型」アプローチを統合し、創薬の早期段階におけるDMTAサイクルを効率化するための画期的な情報プラットフォームです。
このシステムを連携することにより、以下の様々な機能が追加されます。
試験依頼の登録
自動的にアイディア化合物に試験値を表示
各種マスター（コメントマスター、試験タイプなど）管理
Design Hub上のステータスを自動的に「試験完了」に変更
Design Hubからの試験依頼 このように様々な機能が追加されることにより、Quick Requestを有効活用できるだけでなく、お客様のDMTAサイクルの効率化にも役立ちます。
その他オプション
化合物データベースとの連携
試験値データベースとの連携による、自動試験完了検知
自社データベースとの連携による、構造式表示やIDチェック
サンプル・ロットデータベース連携による、試験依頼を行うサンプル・ロットの選択
プロジェクトマスターとの連携による、プロジェクトベースのアクセス制御
導入について
ブラウザ
ウェブブラウザがあればどこからでも利用可能
例：Google Chrome, Internet Explorer, etc...
サーバー
データベース
カタログについて
Quick Requestの機能をまとめたカタログは、以下のダウンロードボタンからダウンロード下さい。
