Markush search
マーカッシュ構造のケミカルスペースを瞬時に検索
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データサイエンス / 化学ソフト / 化学特許 / 開発ツールキット
Markush Search：マーカッシュ構造をDB化し構造検索を実現
Markush SearchはMarkush Enumeration pluginを包含しています。これらの2つのツールを用いることにより、複雑なマーカッシュ構造の解析やマーカッシュ構造によって記述されたケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にします。 また、DARC formatのインポート機能を実装しており、Tomson Reuters社の提供する特許のデータベースMMS (Merged Markush Service)を利用することができます。Markush Searchは、特許出願などに用いられるマーカッシュ構造をデータベースに登録し、エニュメレーションすることなく、部分構造検索や完全一致検索を実現するJChem Base、JChem CartridgeおよびInstant JChem用のアドオンです。
Markush Searchは現在下記のような一般化表現をサポートしています。- R-group (無限のネスティングをサポート）
- アトムボンドリスト
- リンクノード及びリピーティングユニット
- ポジションバリエーションボンド
- ホモロジーバリエーション（alkyl, arylなどのジェネリックアトム。ユーザーによる定義も可能）
Markush Enumaration
マーカッシュ構造から個別構造を生成したり、個別構造の数をカウントすることができます。
Markush Viewer
多くのRグループが定義された複雑なマーカッシュ構造を見やすく表示することは容易ではありません。Markush Viwerはマーカッシュ構造をインポートして、視覚的に見やすく表示します。マーカッシュ構造の骨格とすべてのRグループは階層的なリスト形式により表示されます。ユーザーはクリックすることによりそれぞれのRグループに異なる置換基を指定して表示させることができます。
Markush structures at ChemAxon
Data Reduction from Patents; How Chemical Structures in Patents Are Disclosed, Indexed and Retrieved, and What Do They Mean
May 2012 Author: Brian Larner (Thomson Reuters)
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