Targeted Protein Degrader の創薬が加速する中、有用なインサイトは単一化合物からではなく、化学シリーズに繰り返し現れるパターン、すなわち分子設計と生物活性をつなぐ共通スキャフォールドから導かれることが多くなっています。この複雑性を理解できるよう支援するため、GOSTARᵀᴹ TPD プラットフォームに Scaffold Landscape Analysis モジュールが新たに追加されました。本機能は、特許化合物および文献公開された数千件の Degrader を構造類似性にもとづきクラスタ化し、主要スキャフォールドの Landscape として可視化します。さらに、ターゲット、企業、アッセイデータなどの文脈情報も付加されます。
新規 Ligase Ligand の探索、SAR 多様性の評価、あるいは FTO の観点で競争環境におけるスキャフォールド Landscape を分析する場合など、Degrader 化学空間を効率的に探索し、構造起点のトレンドを大規模に把握する手段をこのツールが提供します。
Scaffold Clustering を通じて創薬設計と戦略立案を加速
Scaffold レベルでの分析により、大規模な SAR データセットをより分かりやすく解釈でき、意思決定に役立つパターンの発見を容易にします。
この分析は、以下のような取り組みを支援します。
- 次世代 Degrader の設計
- IP の空白領域および過密化した Chemotype の把握
- 有意義な SAR の深さを持つリードシリーズの優先順位付け
GOSTARᵀᴹ TPD Scaffold Landscape Analysis の主な特徴
類似性に基づく Treemap Clustering
数千件の Scaffold を分子類似性にもとづき直感的なクラスターに分類します。ターゲット特化型分析では、任意の TPD 関連ターゲットでフィルタリングし、文献に公開されたDegrader によって形成された Scaffold 空間を可視化できます。
企業別マッピング
各企業がどの領域に Scaffold を提供しているかを迅速に把握できます。
Substructure マッピング
Scaffold 構造にもとづいて注目領域にズームインし、その Scaffold がターゲットや企業を横断してどの程度探索されてきたかを評価できます。これにより、未開拓の Chemotype の特定や、過密化した IP 領域の把握が容易になります。
下流分析のためのエクスポート機能
クラスター単位の化合物とメタデータをエクスポートし、オフラインでの探索、モデリング、IP Landscape 分析に活用できます。
Figure 1.
ぜひお試しください
Scaffold Landscape Analysis は、すべての GOSTARᵀᴹ TPD ユーザーに提供されています。「Scaffold Landscape Analysis」タブから、興味のあるターゲットまたは企業を選択することで、Protein Degradation の未来を形づくる Chemotype を探索できます。
さらなる機能強化を近日公開予定です — どうぞご期待ください。
SAR データからより迅速にインサイトを獲得！高速かつ効率的に創薬インサイトを得られるよう強化された GOSTARᵀᴹ SAR データベースをご活用ください。
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