JChem Engines

ケミカルインテリジェンスをデータベースへ統合

化学者と共同開発したJChem Engineは、化学インテリジェンスを研究情報システムと統合し、化学構造検索機能を提供します。わずか数秒で、非常に高い精度を持つ単独検索結果及び複合検索結果を提供します。これにより、研究者は迅速に必要なデータを取得し、研究プロジェクトの次のフェーズへと進むことが可能になります。 JChemエンジンはパフォーマンスの低下を招くことなく数千万のデータセットを効率的に処理する能力を有しています。私たちのソリューションは高性能を発揮し、IT環境にシームレスに統合することが可能です。

データ管理機能は、ChemAxonアプリケーションの多種多様な統合システム全体に広く埋め込まれたコアエンジンであり、研究情報科学システムが依存する高速で目に見えないバックボーンを提供します。

「ケミカルインテリジェンス」をバックエンドで提供し、さまざまなデータベース管理システム(Oracle、PostgreSQL、MySQL、MSSQLなど)に化学情報を格納し、複雑な構造・反応検索検索をはじめとする化学構造を処理するための高度な機能を提供します。

JChem製品

JChemは、多様なワークフローと統合プラットフォームのための化学情報学のバックエンドテクノロジーです。
  • JChem Base: Javaおよび.NETアプリケーションのコアエンジン

  • JChem Microservices: JChem エンジンをWeb サービスとして提供

  • JChem PostgreSQL Cartridge: PostgreSQLに化学機能を提供

  • JChem Oracle Cartridge: 化学機能をOracleに統合

  • JChem Choral Cartridge: 第二世代のJChemエンジンで化学機能をOracleに統合

JChem Baseテクノロジー

JChem Baseは、化学構造と事前に計算されたメタデータを、構造情報と非構造情報を組み合わせた専用のデータベーステーブルに保存します。このテクノロジーは、微調整されたステレオ検索と互変異性検索、リアクションクエリ(リアクションマッピングを含む)、汎用クエリアトム、Rグループクエリ式、SMARTS文字列など、高速で広範なクエリオプションスペースを提供します。JChemでのクエリの詳細をご覧ください

JChem Baseは、化学物質情報を扱う開発者およびインテグレーター向けの簡単なツールキットです。多種多様な関連ワークフローに適合するために、ChemAxonアプリケーションはネイティブでサポートされています。

 

例:

JChem Microservices

最近ではChemAxon製品の様々な機能の領域を小さな個別のサービスモジュール「マイクロサービス」として提供することを開始しました。現時点では次のサービスモジュールを提供しています。

JChem Oracleカートリッジ

JChem Oracle Cartridgeは、OracleのSQL言語を拡張し、JChem Baseの化学インテリジェンスをSQLからシームレスに利用できるようにする、ライフサイエンス・化学業界向けのエンタープライズソリューションです。

JChem Oracle Cartridgeの詳細を読む

JChem PostgreSQLカートリッジ

最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、PostgreSQLインターフェースにケミカルインテリジェンスを追加します。

JChem PostgreSQLカートリッジを用いると、PostgreSQLデータベースで化学データベース管理および検索機能が出来るようになります。

化学構造を保存するために、カスタムのカラムタイプで「Molecule」という名前が表示されます。

Moleculeカラムは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。

JChem PostgreSQLカートリッジの詳細を読む

JChem Choral

最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、Oracleデータベースに化学データベース管理および検索機能を追加します。データベース内の化学構造を処理するために、カスタムインデックスタイプが適用されます。インデックスタイプは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。

JChem Choralについてもっと読む

BLOG

ブログ

SwissDrugDesign

SwissDrugDesignプロジェクト:オンライン創薬の最前線

SwissDrugDesignプロジェクトは、研究者、学生、教育者を支援するために、最先端のコンピューター支援創薬ツールを無料でオンライン提供しています。本ブログでは、SwissDrugDesignプロジェクトの概要とその進化、ChemAxon製品との関係性について解説します。

chemical space-Mar-25-2025-04-00-01-1256-PM

大規模ライブラリワークフローにおけるReactor

数十億規模の化学ライブラリーの利用が標準化しており、クラウド技術やAI/MLの進展がその活用を加速させています。従来のツールでは対応が難しく、新しい表現形式や検索手法が求められています。Reactorを利用したワークフローの重要性について解説します。

20211105121111

類似構造検索について

構造類似検索について、類似度計算方法やフィンガープリントについて詳しく解説。MadFastを使用した超高速検索にも触れ、創薬研究における重要性を紹介。Chemoinformaticsの専門家向けの情報。

20210806115016

ステレオ表記の取り扱い

創薬研究開発の過程では不斉中心を持つ化合物が多く合成されるため、立体異性体(ステレオアイソマー)の化合物情報を管理するための表記方法、構造検索のオプションが用意されています。立体異性体は化学的にいくつかの種類があり、システム上の取り扱いについても複雑です。

20210510175718

構造検索の種類

既知有機化合物の数が1880 年から1960 年にかけて約12,000 化合物から100 万化合物に急増したように、有機化学は20 世紀に急速に発展しました。今日では、ハイスループットスクリーニングやコンビナトリアルケミストリーなどの新たな手法を用いた大規模化合物ライブラリーに対する探索が行われています。

20210201124449

化合物データベースを作成する(JChemBase編)

数百万の化合物構造と構造情報に紐づくデータを安定して管理する方法としてリレーショナルデータベース(以下DB)が広く用いられています。今回は、そのDBのバックエンドで動作し、構造検索などの化学に特化した機能を利用できるようにするJChem Base1について紹介します。

RELATION PRODUCTS

関連製品・サービス

QR_iconpptx-2

試験依頼システム Quick Request

Quick Requestは効率的な試験依頼環境を実現するためのシステムです。 試験依頼に関するあらゆる情報・コミュニケーションを一元化し効率的なラボを実現します。

Marvin-Sketch_thumbnail

Marvin Sketch

Marvin SketchはJavaベースの構造描画ツールです。直感的な操作で、構造・反応・クエリーの描画が可能です。化学構造の描画、インポート、編集、エクスポートを1つのシンプルなアプリケーションで簡単に行うことができます。 Marvin Sketchはスタンドアロンの描画ツールとしての利用はもちろん、Webアプリケーションやカスタムアプリケーションに組み込んで利用することができま す。Marvin Sketchでは各種ファイルフォーマット※の読み書きができ、Chem Draw ProやISIS/Drawなどからコピーペーストできます。また、豊富なプロパティー計算用プラグインモジュール「Calculator Plugins」を組み込み、pKaなどのプロパティー計算結果をグラフィカルに表示できます

Marvin

Marvin 構造式描画ソフト

Marvinは構造式を綺麗にそして最速で描画できる次世代の構造描画ツールです。研究者は自分の考えを、素早くて美しい視覚表現に変換できます。化学構造、印、テキストなど、多数のオブジェクトを1つのキャンバスで処理し、絶対的な精度で整列させます。

Contact

お問い合わせ

製薬・バイオテクノロジーのDXならパトコアにおまかせください