Chemaxon Structure Enumeration Toolkit
反応およびMarkush定義に基づく化学構造列挙を通じて、
仮想ライブラリ生成と化学空間探索を可能に
Chemaxon Structure Enumeration Toolkitは、反応スキームやMarkush定義に基づいて仮想化合物ライブラリを生成・展開するための列挙機能群です。
ReactorおよびMarkush Enumerationを中核に、フィンガープリントや2D類似性評価と組み合わせることで、大規模化学空間の探索と候補選別を支援します。
ツールキット内モジュール一覧
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Reactor
JChem 技術に基づく仮想反応列挙エンジンです。試薬を事前に選別することなく、化学的に妥当な生成物を生成することができます。
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Markush Enumeration
Markush構造から具体的な化学構造を列挙する解析ツールです。完全列挙、部分列挙、ランダム列挙などにより、特許やコンビナトリアルライブラリが覆う化学空間を効率的に把握できます。
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分子構造を円形近傍に基づいて数値化する高性能なフィンガープリント機能です。
類似性検索や創薬向け解析に広く利用され、FCFP では機能的に等価な構造を同一視する表現が可能です。
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Screen2D
2D 分子記述子やフィンガープリントを用いて、化合物ライブラリに対する高速な類似性検索と仮想スクリーニングを行います。
ECFP/FCFP や化学フィンガープリントなどを利用し、創薬初期段階における類縁化合物探索やライブラリ解析を効率化します。 -
Molecular Descriptors
分子構造から多様な分子記述子やフィンガープリントを生成します。
生成された記述子は、類似性検索や仮想スクリーニング、化合物ライブラリ解析に利用され、
データベースやワークフローへの統合も可能です。 -
Python Enumeration APIs
反応および構造列挙機能をPython から利用できる開発者向け API です。
反応列挙や Markush 構造展開を自動化し、データ解析や創薬パイプラインに柔軟に組み込むことができます。 -
JMS Reactor
Reactor(反応列挙エンジン)をサーバーサイドで実行するためのコンポーネントです。
Reactor の機能を JMS(Java Message Service)経由で呼び出します。
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JMS Markush Enumeration
Markush Enumeration(マルクシュ構造列挙)機能を、サーバーサイドで実行するためのコンポーネントです。
Markush Enumeration の機能を JMS(Java Message Service)経由で呼び出します。 -
.Net
反応および構造列挙機能を.NET アプリケーションから利用できる開発者向け API です。
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Java Enumeration APIs
反応および構造列挙機能をJava から利用できる開発者向け API です。
反応列挙や Markush 構造展開を自動化し、データ解析や創薬パイプラインに柔軟に組み込むことができます。