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Bioinformatics Services
バイオメディカルデータの量が増えるにつれ、創薬・開発プログラムの複雑さも増しています。その中で、データの取得から解析及び生物学的解釈までを高品質で提供します。また、関連するシステムやカスタムパイプラインの開発までお客様のご要望に合わせたサービスを提供いたします。 -
GOSTAR|SARデータベース
GOSTARを使うだけで、最新の整理されたSAR情報が入手でき、研究に集中できます。AIモデルを構築するのに、データを集めたり整理したりする必要はありません。Excelraが専門化チームによるマニュアルキュレーションで構築されたGOSTARは、化学構造と生物学的、薬理学的、治療学的活性を結びつけることで、数百万の化合物の360度ビューを提供します -
マーカッシュキュレーション
Markush構造は、化合物クラスを一般的な表記で記述したもので、特許請求の範囲やコンビナトリアルライブラリによく使用されます。 Excelraでは、お客様の化学データベースのご要望にお応えし、スキャフォールドベースの研究をサポートするために、 お客様が指定する特許のマーカッシュクレームをChemaxonのマーカッシュ技術に基づく電子化を行うサービスです。 Excelraは、非構造化データを抽出、構造化、整理し、高品質で分析に適した形式に変換する専門知識と経験を有しており、創薬における情報に基づいたデータ駆動型の意思決定を可能にします。
Pipeline Pilot Component Collection
ChemAxonの機能をPipelinePilotに統合
データサイエンス
Pipeline Pilot 用Component Collectionは、ChemAxonの化学情報処理機能をPipelinePilotでご利用頂く為のコンポーネントです。
Chemaxonの技術を多様なインフォマティクス環境で活用することを目指し、包括的なPipeline Pilotコンポーネントコレクションを開発し、無償で提供しています。
これにより、Chemaxonテクノロジーが統合され、Pipeline Pilotの化学関連ワークフローの幅が広がります。
データマイニング、データ処理、統計分析といった複雑なコンピュータータスク簡単にデザインし、Chemaxonのコンポーネントのパワーを活用して、実行できます。
Pipeline PilotとChemaxonの両方の強みを生かすことで、ユーザーは問題解決の手掛かりを見つけることができます。
Pipeline Pilotとは
Pipeline Pilotは、Accelrys社のワークフロー管理システムで、迅速なデータアクセスや視覚化を可能とします。 Pipeline Pilotとそれに統合したアプリケーションは、研究開発組織でのモデリングやシミュレーション、情報科学、科学的ビジネスインテリジェンスニーズに柔軟に応えます。 ChemAxon社は、Accelrysの独立ソフトウェア・ベンダー(ISV)パートナーです。 本Component Collectionは無料※で提供され、すべてChemAxon社によって開発・サポートされています。
ご利用いただける機能
現在16種類のChemAxonツール・ツールキット・機能を、Pipeline Pilot内でご利用いただけます。もっとも重要なコンポーネントのうち、主な機能は以下のとおりです。
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Marvin Suite (化学構造描画ソフト)
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Standardizer (構造式表記の標準化ツール)
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Reactor (バーチャル反応ツール)
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JChem Base (化学データベース管理・検索)
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Markush enumeration (Markush構造の展開ツール)
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Name to StructureおよびStructure to Name (ネーミングツール)
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Calculator Plugin (logP, logD, pKa, tautomer生成、コンフォーマー生成など各種物性計算や予測ツール)
無料ダウンロード
■ユーザー登録 ダウンロードの前に、ChemAxonユーザー登録が必要です。 未登録の場合は、以下のリンク先より登録およびログインした後、コンポーネントのダウンロードにお進みください。
https://www.chemaxon.com/forum/profile.php?mode=register&agreed=true
■Component Collection のダウンロードURL
https://www.chemaxon.com/download/pipeline-pilot-components/
<本コンポーネントでご利用いただける製品・機能一覧>
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Chemical Terms (logP, logD, pkA etc.)
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Document to Structure • JChem Base chemical DB
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JChem Base structure and formula search
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JChem for Excel export
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JKlustor
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Markush Enumeration
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MarvinSketch
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MarvinView
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MarvinSpace
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MolConverter
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Naming
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Reactor
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RECAP Fragmentation
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Standardizer
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Structure Checker
※ Pipeline Pilot用Component Collectionのダウンロードおよびご利用は無料ですが、各ChemAxonツールのご利用にあたってはライセンス契約が必要です。
関連製品・サービス