Name to Structure

IUPAC名,CAS番号,一般名から構造式を生成

製品カテゴリ

化学テキストマイニングツール

  • Name to StructureはIUPAC名、CAS番号、一般名などから化学構造式を生成します。

    名称→構造式の一括変換

    本ツールは、名称から構造式に一括変換する方法を複数提供しています。
    Instant JChemやJChem for Excel、MarvinViewにおいては、名称が記載されたテキストファイルをインポートすると自動的に構造が認識され、SDファイルからのインポートと同じように構造式として読み込むことができます。
    Pipeline pilot や Knimeのようなワークフローツールについては、コンポーネントの一つとして変換ツールが実装されています。 Molcovertやcxcalcなどのコマンドラインツールからも名称⇔構造変換が可能です。
    また、APIを用いてカスタムアプリケーションに変換機能を組み込むことが出来ます。

    Document to Structure アドオン

    html、テキスト、PDFファイル内の化学名を認識し、構造式に変換します。
    Document to structureはAPI及びコマンドラインから利用できます。
    本ツールは化学名を認識し、構造に変換するだけ でなく、ファイル内の化学名の位置情報も取得することができます。 Document to structure APIはフリーのchemicalize.orgに実装されており、Webページ内で化学名を見つけ構造に変換するのに用いられています。 Knimeに統合されたDocument to Structureを用いるとテキストマイニングの自動化が可能です。

    無償Webアプリケーション「chemicalize.org」

    ChemAxonではName to structureを無償Webアプリケーションである、chemicalize.orgで既に実装されており、Webページ上でみつかった化学名を認識し、構造をポップアップ表示できるようにしました。

    ユーザーは、webサイトのアドレス又は化学名、あるいはファイルの内容をタイプ又はペーストすると、それぞれ、解析され構造式のイメージ付のアノテーションが付加されたwebページ、単独の構造式のイメージ、変換された構造付のデータページを得ることができます。

    Webパージをchemicalize.org からブラウジングする際は、リンク先のページもまた同様に”chemicalize”されます。是非http://www.chemicalize.orgを訪問してお試し下さい。

    chemicalize.org(Free)ダウンロードはコチラ

    Naming and chemicalize.org

    Applying ChemAxon name-structure to chemical patent data – Nicholas Goncharoff (SureChem)