Markush search

マーカッシュ構造のケミカルスペースを瞬時に検索

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Markush Search

マーカッシュ構造をDB化し構造検索を実現

Markush Searchは、特許出願などに用いられるマーカッシュ構造をデータベースに登録し、エニュメレーションすることなく、部分構造検索や完全一致検索を実現するJChem Base、JChem CartridgeおよびInstant JChem用のアドオンです。

Markush Searchは現在下記のような一般化表現をサポートしています。

  • R-group (無限のネスティングをサポート)

  • アトムボンドリスト

  • リンクノード及びリピーティングユニット

  • ポジションバリエーションボンド

  • ホモロジーバリエーション(alkyl, arylなどのジェネリックアトム。ユーザーによる定義も可能)

Markush SearchはMarkush Enumeration pluginを包含しています。これらの2つのツールを用いることにより、複雑なマーカッシュ構造の解析やマーカッシュ構造によって記述されたケミストリースペースのブラウジングを格段に容易にします。 また、DARC formatのインポート機能を実装しており、Tomson Reuters社の提供する特許のデータベースMMS (Merged Markush Service)を利用することができます。

enum

Markush Enumaration

マーカッシュ構造から個別構造を生成したり、個別構造の数をカウントすることができます。

markush-viewer

Markush Viewer

多くのRグループが定義された複雑なマーカッシュ構造を見やすく表示することは容易ではありません。Markush Viwerはマーカッシュ構造をインポートして、視覚的に見やすく表示します。マーカッシュ構造の骨格とすべてのRグループは階層的なリスト形式により表示されます。ユーザーはクリックすることによりそれぞれのRグループに異なる置換基を指定して表示させることができます。

Markush structures at ChemAxon

Data Reduction from Patents; How Chemical Structures in Patents Are Disclosed, Indexed and Retrieved, and What Do They Mean

May 2012 Author: Brian Larner (Thomson Reuters) 

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Patsnap Chemical

化学構造検索又はCAS登録や名称、各種プロパティーなどによる検索により化学物質を特定し、それらに関連する特許、文献、リストを整理して表示します。さらに特許解析アプリのAnalyticsとシームレスに連動し、化学構造と特許の検索・解析をワンストップで実現します。有望なリード化合物を迅速に特定し、法的リスクを最小限に抑えることで、研究開発のチャンスを広げ、新しい組成物の上市を成功させる可能性を高めます。

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GOSTAR™ Small Molecules

創薬研究において、包括的なデータは欠かせません。GOSTAR™ Small Molecules は、1,060 万件を超える化合物の構造―活性データを提供します。このデータは、メディシナルケミストによる三段階のプロセスで手作業により標準化・品質管理されており、信頼性の高い情報をお届けします。世界の主要製薬企業トップ20社のうち、約15社が創薬研究に不可欠なツールとして GOSTAR™ を採用している理由をご覧ください。

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