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研究情報基盤 / 開発ツールキット
ケミカルインテリジェンスをデータベースへ統合
化学者と共同開発したJChem Engineは、化学インテリジェンスを研究情報システムと統合し、化学構造検索機能を提供します。わずか数秒で、非常に高い精度を持つ単独検索結果及び複合検索結果を提供します。これにより、研究者は迅速に必要なデータを取得し、研究プロジェクトの次のフェーズへと進むことが可能になります。 JChemエンジンはパフォーマンスの低下を招くことなく数千万のデータセットを効率的に処理する能力を有しています。私たちのソリューションは高性能を発揮し、IT環境にシームレスに統合することが可能です。
データ管理機能は、ChemAxonアプリケーションの多種多様な統合システム全体に広く埋め込まれたコアエンジンであり、研究情報科学システムが依存する高速で目に見えないバックボーンを提供します。
「ケミカルインテリジェンス」をバックエンドで提供し、さまざまなデータベース管理システム(Oracle、PostgreSQL、MySQL、MSSQLなど)に化学情報を格納し、複雑な構造・反応検索検索をはじめとする化学構造を処理するための高度な機能を提供します。
JChem製品
JChemは、多様なワークフローと統合プラットフォームのための化学情報学のバックエンドテクノロジーです。
- JChem Base: Javaおよび.NETアプリケーションのコアエンジン
- JChem Microservices: JChem エンジンをWeb サービスとして提供
- JChem PostgreSQL Cartridge: PostgreSQLに化学機能を提供
- JChem Oracle Cartridge: 化学機能をOracleに統合
- JChem Choral Cartridge: 第二世代のJChemエンジンで化学機能をOracleに統合
JChem Baseテクノロジー
JChem Baseは、化学構造と事前に計算されたメタデータを、構造情報と非構造情報を組み合わせた専用のデータベーステーブルに保存します。このテクノロジーは、微調整されたステレオ検索と互変異性検索、リアクションクエリ(リアクションマッピングを含む)、汎用クエリアトム、Rグループクエリ式、SMARTS文字列など、高速で広範なクエリオプションスペースを提供します。JChemでのクエリの詳細をご覧ください。
JChem Baseは、化学物質情報を扱う開発者およびインテグレーター向けの簡単なツールキットです。多種多様な関連ワークフローに適合するために、ChemAxonアプリケーションはネイティブでサポートされています。
例:
- 複雑な化学クエリ、式、ルールのためのケミカルターム(Chemical Terms)言語
- 正規化と正規化のための標準化コンポーネント
- 予測および構造ベースの記述子用の化学計算プラグイン(Calculator Plugins)
- Markush検索アドオン。一般的な構造を登録し、個別の構造式を発生させることなく、部分構造一致、完全構造一致、重複構造検索が可能
- Reactor、反応ベースの仮想ライブラリ生成用
JChem Microservices
最近ではChemAxon製品の様々な機能の領域を小さな個別のサービスモジュール「マイクロサービス」として提供することを開始しました。現時点では次のサービスモジュールを提供しています。
- 化学データセットの検索(DB Web Services)
- 化学ファイル形式の変換(IO Web Services)
- 構造操作処理(Structure Manipulation)
- 物性計算処理(Calculations Web Services)
- マーカッシュ構造から個別構造の生成(Markush Web Services)
JChem Oracleカートリッジ
JChem Oracle Cartridgeは、OracleのSQL言語を拡張し、JChem Baseの化学インテリジェンスをSQLからシームレスに利用できるようにする、ライフサイエンス・化学業界向けのエンタープライズソリューションです。
JChem PostgreSQLカートリッジ
最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、PostgreSQLインターフェースにケミカルインテリジェンスを追加します。
JChem PostgreSQLカートリッジを用いると、PostgreSQLデータベースで化学データベース管理および検索機能が出来るようになります。
化学構造を保存するために、カスタムのカラムタイプで「Molecule」という名前が表示されます。
Moleculeカラムは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。
JChem Choral
最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、Oracleデータベースに化学データベース管理および検索機能を追加します。データベース内の化学構造を処理するために、カスタムインデックスタイプが適用されます。インデックスタイプは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。
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