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研究情報基盤 / 開発ツールキット
ケミカルインテリジェンスでオブジェクトリレーショナルデータベース管理システムを強化
JChemテクノロジーは、化学構造の表示、検索、保存、構造および非構造データ管理機能のための高度な実装を提供します。
データ管理機能は、ChemAxonアプリケーションの多種多様な統合システム全体に広く埋め込まれたコアエンジンであり、研究情報科学システムが依存する高速で目に見えないバックボーンを提供します。
「ケミカルインテリジェンス」をバックエンドで提供し、さまざまなデータベース管理システム(Oracle、PostgreSQL、MySQL、MSSQLなど)に化学情報を格納し、複雑な構造・反応検索検索をはじめとする化学構造を処理するための高度な機能を提供します。
JChemスイート
JChemスイートは、さまざまなデータベースエンジン上で3つの異なるインターフェイス言語を提供する5つのアプリケーションで構成されています。JChemは、多様なワークフローと統合プラットフォームのための化学情報学のバックエンドテクノロジーです。
- JChem Baseは、Javaおよび.NETアプリケーションのコアエンジンです。
- JChem Microservicesは、第2世代のJChemエンジンを使用する特殊なモジュールを介して、化学インテリジェントプラットフォームの機能をWebに拡張します
- JChem Oracle Cartridgeは化学機能をOracleに統合します
- JChem PostgreSQL Cartridgeは、第二世代のJChemエンジンを用いて、PostgreSQLに化学機能を提供します。
- JChem Choralは、第二世代のJChemエンジンを用いたOracle Cartridgeです。
- JChem Neo4jカートリッジは、グラフデータベースで化学検索を提供します。
JChem Baseテクノロジー
JChem Baseは、化学構造と事前に計算されたメタデータを、構造情報と非構造情報を組み合わせた専用のデータベーステーブルに保存します。このテクノロジーは、微調整されたステレオ検索と互変異性検索、リアクションクエリ(リアクションマッピングを含む)、汎用クエリアトム、Rグループクエリ式、SMARTS文字列など、高速で広範なクエリオプションスペースを提供します。JChemでのクエリの詳細をご覧ください。
JChem Baseは、化学物質情報を扱う開発者およびインテグレーター向けの簡単なツールキットです。多種多様な関連ワークフローに適合するために、ChemAxonアプリケーションはネイティブでサポートされています。例:
- 複雑な化学クエリ、式、ルールのためのケミカルターム(Chemical Terms)言語
- 正規化と正規化のための標準化コンポーネント
- 予測および構造ベースの記述子用の化学計算プラグイン(Calculator Plugins)
- Markush検索アドオン。一般的な構造を登録し、個別の構造式を発生させることなく、部分構造一致、完全構造一致、重複構造検索が可能
- Reactor、反応ベースの仮想ライブラリ生成用
JChem Microservices
最近ではChemAxon製品の様々な機能の領域を小さな個別のサービスモジュール「マイクロサービス」として提供することを開始しました。現時点では次のサービスモジュールを提供しています。
JChem Oracleカートリッジ
JChem Oracle Cartridgeは、OracleのSQL言語を拡張し、JChem Baseの化学インテリジェンスをSQLからシームレスに利用できるようにする、ライフサイエンス・化学業界向けのエンタープライズソリューションです。
JChem PostgreSQLカートリッジ
最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、PostgreSQLインターフェースにケミカルインテリジェンスを追加します。
JChem PostgreSQLカートリッジを用いると、PostgreSQLデータベースで化学データベース管理および検索機能が出来るようになります。
化学構造を保存するために、カスタムのカラムタイプで「Molecule」という名前が表示されます。
Moleculeカラムは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。
JChem Choral
最先端のテクノロジーを用いた、高性能な第2世代のJChemエンジンを用いて、Oracleデータベースに化学データベース管理および検索機能を追加します。データベース内の化学構造を処理するために、カスタムインデックスタイプが適用されます。インデックスタイプは、標準化と互変異性体の取り扱いに関するビジネスルールに基づいてカスタマイズできます。
JChem Neo4jカートリッジ
JChem Neo4jカートリッジは、グラフデータベースNeo4jの利点と、ChemAxonの第2世代化学検索エンジンの高性能および化学インテリジェンスを組み合わせています。JChem Neo4jカートリッジは、グラフデータベース機能を次のように拡張します
- グラフデータベースノードに保存されている化学構造とその特性
- そしてそれらの間の定義された関係
すぐに検索できます。
ドキュメントでJChem Neo4jカートリッジの詳細を読む
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