Chemaxon Descriptor Generation Toolkit
化合物の性質や構造特徴を“記述子(数値/指紋/予測値)として生成する”ための機能群
化合物構造からpKa、logP/logD、溶解度、ADMET関連指標、元素組成、2D/3D構造記述子、ECFP/FCFP指紋、NMR予測および2D類似性評価を生成する、分子記述子算出に特化した計算・予測機能群です。
得られた記述子は、スクリーニング、クラスタリング、QSAR/QSPR、解析および設計判断の下流工程における共通入力として利用されます。
ツールキット内モジュール一覧
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Protonation
pKa(酸塩基乖離点数)や、pHに対するミクロ種(microspecies)の分布、指定pHでの主要ミクロ種、等電点など、イオン化状態に関す予測を行います。
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Partitioning
logP(分配係数)や logD(pH依存の分配)、HLBなど 疎水性/親水性バランス(分配)を表す指標を計算します。 -
化合物の水溶解性(水中溶解度)を予測するための物性予測プラグインです。
化学構造から pH 依存の溶解度(log S、mol/L、mg/mL)、内在的溶解性、および定性的な溶解性カテゴリを算出します。
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心毒性の指標であるhERG阻害能を、機械学習も用いた予測モデルにより計算します。
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正確質量/公称質量、分子量、原子数、元素組成、分子式、同位体分布(質量スペクトル)など 基本的な組成・質量関連の計算を提供します。
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HBDA(H-bond donor/acceptor)数、2Dトポロジー記述子、3D幾何記述子、分子表面、3D配座生成・分子動力学、3Dアラインメント、電子構造関連のプロパティ計算など、幅広い“構造系計算”をまとめたバンドルです。
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Molecular Descriptors
分子構造から多様な分子記述子やフィンガープリントを生成します。
生成された記述子は、類似性検索や仮想スクリーニング、化合物ライブラリ解析に利用され、
データベースやワークフローへの統合も可能です。 -
Screen2D
2D 分子記述子やフィンガープリントを用いて、化合物ライブラリに対する高速な類似性検索と仮想スクリーニングを行います。ECFP/FCFP や化学フィンガープリントなどを利用し、創薬初期段階における類縁化合物探索やライブラリ解析を効率化します。 -
ECFP/FCFP
分子構造を円形近傍に基づいて数値化する高性能なフィンガープリント機能です。
類似性検索や創薬向け解析に広く利用され、FCFP では機能的に等価な構造を同一視する表現が可能です。 -
NMR
^13C と ^1H のNMRスペクトル予測、JCAMP-DXのインポート・表示など NMRスペクトルの予測と取り扱いを提供し、
構造解析を支援します。
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Python Calculator APIs
化学構造を入力として、分子記述子や物性値(pKa、logP/logD、溶解度など)を計算できる、ローカルまたはサーバー上で動作する Python 向け開発者 API です。
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JMS Calculators
化学構造を入力として、分子記述子や物性値(pKa、logP/logD、溶解度など)を計算できる、クラウドベースのREST APIです。
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.Net
化学構造を入力として、分子記述子や物性値(pKa、logP/logD、溶解度など)を計算できる、.NET 環境上で動作する開発者 API です。
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Java Calculator APIs
化学構造を入力として、分子記述子や物性値(pKa、logP/logD、溶解度など)を計算できる、Java アプリケーション上で動作する開発者 API です。