医薬品およびバイオテクノロジーの絶えず進化する分野においては、研究開発（R&D）プロセス全体にわたり、精度と効率が何よりも重要です。生命科学の急速な進歩に対応するには、革新的なソリューションが不可欠です。
本記事では、Patsnap Bioが新たにリリースした世界初の化学修飾検索ツールに注目し、これがどのようにシーケンス検索技術を向上させ、フリーダム・トゥ・オペレート（FTO）分析の効率化に寄与するかを詳しくご紹介します。
シーケンス修飾とは？
シーケンス修飾は、医薬品開発および知的財産（IP）保護の中核をなす要素です。これは、特定の領域に化学基を付加することによって、タンパク質または核酸の配列を変化させ、機能的な変化を引き起こす手法です。蛍光ラベル化、糖鎖修飾（グリコシル化）、リン酸化といった手法は、その一例に過ぎず、高いバイオアベイラビリティや標的特異性、半減期の延長、非標的への作用の低減といった最適な治療特性を実現するために活用されています。シーケンス修飾の複雑さを理解することで、研究者は治療薬の開発に伴う課題をより効果的に乗り越えることができ、最終的には医療の最前線を切り拓き、患者の治療成果を向上させることが可能となります。
修飾ヌクレオチド配列の例（特許 US20180195070A1 ：LPA の遺伝子発現を阻害するための組成物および方法 より）
出典：Patsnap Bio
シーケンスの特許性の確立
新たな配列の特許性を判断するうえで、シーケンスに基づく検索は極めて重要です。これにより、既存の知的財産（IP）状況を把握し、潜在的な侵害リスクを特定することが可能になります。特に核酸技術の分野では、化学修飾を戦略的に活用することが不可欠です。こうした修飾は、オリゴヌクレオチドの効果を最大限に引き出す医薬品の設計において重要な役割を果たし、複雑な疾患への対応を可能にします。
その重要性にもかかわらず、特許における化学修飾の記述に標準化が欠如していることは、依然として大きな課題です。修飾に関する特許の記述は非常に個別的であり、たとえば「2’-O-methyl」と「2’-ome」はいずれも同じrRNAの修飾を指しているにもかかわらず、異なる表現が用いられています。このような表記のばらつきは、従来の検索手法では関連特許の抽出を困難にし、FTO（フリーダム・トゥ・オペレート）検索の精度を著しく損なう原因となります。
この課題を克服するため、研究者は複数の労力を要する検索手法を駆使せざるを得ません。具体的には、従来のシーケンス検索に加えて、あらゆる修飾表現のバリエーションを網羅するキーワード検索を併用する必要があります。そのうえで、各配列ごとに修飾データを一つひとつ丹念に確認・精査しなければなりません。
Patsnap Bio 修飾検索
Patsnap Bio は、AIを活用することで、シーケンス修飾データの収集および分析をより迅速かつ確信をもって行える環境を提供し、従来の課題を解消します。新たに導入された「修飾検索」機能により、ユーザーは配列を指定することなく、あるいは配列を用いて、部位特異的な修飾を検索することが可能になりました。この機能は、150万件以上の修飾シーケンスを収録したデータベースに基づいています。
この検索機能により、次のような重要な疑問に対する答えを導くことができます：
- この修飾はどの程度広く使用されているのか？
- この修飾を含む既存の先行技術にはどのようなものがあるのか？
- 自分の検索クエリに関連する他の修飾には何があるのか？
検索を開始するには、ユーザーは希望する配列の長さおよび修飾の位置・種類を入力するだけで済みます。必要に応じて、クエリ配列を併用することも可能です。
シーケンス修飾データの網羅的な取得と理解を可能にすることで、Patsnap Bio は研究者、知財専門家、そしてR&D担当者に力を与え、世界水準の治療薬の設計および最適化に対して効果的にアプローチできる環境を提供します。
主な機能
標準化された修飾ライブラリ
高度なAIと丁寧な手作業によるキュレーションを活用し、Patsnap Bio はシーケンス修飾データを標準化されたライブラリとして統合しています。このデータは、化学修飾の9つの主要カテゴリと382のサブカテゴリを含んでおり、非常に広範で網羅的な内容となっています。
柔軟な検索オプション
シーケンスに基づく検索と、シーケンスを必要としない検索の両方に対応しており、特定の修飾に関連する傾向やインサイトを容易に特定できます。シーケンスに基づく検索では、最大200件のターゲット配列を一度に検索でき、ローカルアライメントまたはグローバルアライメントの手法を選択可能です。
2つの検索オプションにより、特定の研究目的に合わせた柔軟な検索が可能になります。
修飾トレンドの可視化
Patsnap Bio は強力な可視化ツールを備えており、検索結果に含まれる化学修飾の分布を直感的に把握することができます。これらのツールにより、検索した配列や修飾タイプに関連する貴重なインサイトを抽出でき、意思決定プロセスの質を高めることが可能になります。
検索結果ページでは、ヒットした配列における主要な修飾トレンドが視覚的に要約されて表示されます。そこから特定の結果を選択し、より詳細な分析へとスムーズに進むことができます。
詳細な出典分析
検索結果に対応する特許情報へ迅速にアクセスし、修飾に関するクレームを深掘りすることで、新たな可能性の発見や発明の特許性評価を効率的に行うことができます。
各ヒット配列には、その修飾が取得された出典情報が表示されており、クリックすることで詳細を確認することができます。
即時修飾レポート
ワンクリックで、ヒットした修飾の分布や、結果セット内に含まれるその他すべてのシーケンス修飾の概要をまとめたレポートを出力できます。これらのレポートは、さらなる分析や意思決定に役立つ実用的なインサイトの特定と整理を迅速に行うことを可能にします。
エクスポート可能な修飾検索レポートには、ヒットした修飾の分布に加えて、ヒット配列内に含まれるその他の修飾の分布もまとめて表示されます。
Patsnap Bio：バイオ医薬品イノベーションの未来を切り拓く
バイオシーケンスの世界において、他に類を見ない機能と洞察を提供する Patsnap Bio は、バイオ医薬品分野に新たな効率性と精度の時代をもたらしています。Patsnap の新機能「修飾検索」について詳しく知りたい方は、ぜひデモをご予約いただくか、Patsnap Bio を今すぐ無料でお試しください。
