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試験依頼システム Quick Request
Quick Requestは効率的な試験依頼環境を実現するためのシステムです。 試験依頼に関するあらゆる情報・コミュニケーションを一元化し効率的なラボを実現します。 -
Bioinformatics Services
バイオメディカルデータの量が増えるにつれ、創薬・開発プログラムの複雑さも増しています。その中で、データの取得から解析及び生物学的解釈までを高品質で提供します。また、関連するシステムやカスタムパイプラインの開発までお客様のご要望に合わせたサービスを提供いたします。 -
Marvin Pro構造式描画ソフト
Marvin Pro は構造式を綺麗にそして最速で描画できる最新の構造描画ツールです。研究者は自分の考えを、素早くて美しい視覚表現に変換できます。Marvin Proは、化学構造、矢印、テキストなど、多数のオブジェクトを1つのキャンバスで処理し、絶対的な精度で整列させます。
Transformer
低分子創薬
データサイエンス
New!
ver2.1より、Matched Molecular Series(MMS)解析機能が実装されました
「○○を改善する構造変換は?」
Transformerは入力した構造をルールに基づき変換し、今まで思い付かなかった構造を自動生成します。リード化合物のSolubilityなどの物性値を改良したい、ターゲットに対する生化学的特性を変化させたい、といった構造最適化段階の化合物設計において威力を発揮します。構造変換ルールベースとしてEMILを標準実装しているほか、ChEMBLデータベースやお客様が自社内で蓄積している化合物ライブラリーのデータもインポートして活用することができます。
主な機能
TransformerはMatched Molecular Pair (MMP) 解析の方法論に基づいています。
これまでに報告された化合物の活性値など、過去の知見を解析し、構造活性相関として評価することができます。
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ルールベースを用いて入力構造を変換した構造を提示
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部分構造を指定して変換構造群を提示
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メドケム向けのシンプルで使いやすいユーザーインターフェース(UI)
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条件を指定して結果に重み付け※注
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物性値
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入力構造と出力構造との構造類似度
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骨格(Structure Framework)の指定による構造変換の制御
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考慮済の変換構造(自社DBに登録済みの構造)を排除
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構造変換ルールの作成に用いたオリジナルデータをシームレスに参照可能
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構造エディタはMarvinとChemDrawが利用可能
構造変換ルールベース
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EMIL
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監修:藤田稔夫京都大学名誉教授
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Bioisostericな約6,700件の変換例を収録
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参考文献
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お客様自身で生成する構造変換ルール
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自社で確立したMMPなどのルールを追加可能
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化合物ペアの構造の差から変換部分を抽出することで、ルールを自動で生成
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ChEMBL等の公的データベースを定期巡回し、ルールを自動で自動することも可能
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※構造変換結果の重みづけについて
指定可能な物性値ChemAxonのCalclator Pluginを内蔵しており、以下を一例とした60種類以上の計算値を指定可能
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Matched Molecular Serise (MMS) 解析機能
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もっと傾向を知りたい
生理活性値は僅かな官能基の変化が著しい影響を及ぼすため、従来のMMP解析の手法では予測が困難とされてきました。この様な対象についても合理的に構造活性相関を把握するため、同じ骨格で複数の官能基を変化させた際の挙動を解析するMMS解析の手法が注目を集めています。
Transformerでは研究者の高度な要求に答えるため、MMS解析機能を新たに実装しました。ソート・フィルター機能によりテーブルを自在にカスタマイズできるため、普段ベンチワークを主に行う研究者でも直感的に知見を得ることができます。
資料はこちらから
カタログをご用意しております。下記「DOWNLOAD」ボタンをクリックしてiPROSからダウンロードをお願いします。
Transformerカタログ
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