-
試験依頼システム Quick Request
Quick Requestは効率的な試験依頼環境を実現するためのシステムです。 試験依頼に関するあらゆる情報・コミュニケーションを一元化し効率的なラボを実現します。 -
Bioinformatics Services
バイオメディカルデータの量が増えるにつれ、創薬・開発プログラムの複雑さも増しています。その中で、データの取得から解析及び生物学的解釈までを高品質で提供します。また、関連するシステムやカスタムパイプラインの開発までお客様のご要望に合わせたサービスを提供いたします。 -
Marvin Pro構造式描画ソフト
Marvin Pro は構造式を綺麗にそして最速で描画できる最新の構造描画ツールです。研究者は自分の考えを、素早くて美しい視覚表現に変換できます。Marvin Proは、化学構造、矢印、テキストなど、多数のオブジェクトを1つのキャンバスで処理し、絶対的な精度で整列させます。
SARvision SM
骨格分類(MCS), SAR解析支援ツール
低分子創薬
データサイエンス
化学ソフト
SARvision SMは、化学者にとって重要な仕事のひとつである構造活性相関の検討を支援するソフトウェアです。
独自の最大共通部分構造(MCS: Maximum Common Substructure) 抽出エンジンにより化学構造データを骨格ごとに分類することができ、SARの検討を容易にします。
骨格は予めリストとして与える必要はなく、読み込まれた化学構造式から自動的に生成されます。
骨格ベースのデータマイニングは、記述子ベースのクラスタリングに比べて化学者の感性に近い評価が行え、スクリーニングデータの評価やHit to Leadやリード最適化ステージでの合成戦略の立案などに力を発揮します。
SARvision SMの特長
-
構造式群から自動的に共通部分骨格を抽出し、骨格ごとに分類したツリーを提示
-
骨格を物性や活性データでソートしたり、スライダーを使った動的な絞込み
-
物性値を計算し、活性値と共に迅速にグラフ化(構造情報とリンク)
-
共通部分構造と置換基を整理しRグループテーブルを瞬時に作成
-
豊富なグラフィック機能(棒グラフ、2D散布図、3D散布図)
-
RグループテーブルをEXCELやWORDへ出力し効率的にレポートを作成(コマンドラインオプションをサポートしており、他のソフトウエアとの連携も可能)
■NEW■ PROTAC解析モジュール新登場!
リンカー解析モジュールオプションが追加され、バイリガンドのSAR研究をルーチン化、かつ容易に実行できるようになりました。この新しい解析ツールはPROTACを研究するために設計されていますが、リンカーによって結合された2つのリガンドであれば、どのような分子にも対応可能です。
詳細につきましては、「PROTAC解析モジュール」ページをご覧ください。
*分子をリンカーと2つのリガンドに分解し、SARvision|SMのSAR Tableで簡単に解析できるようにします。PROTAC分子の場合、E3リガーゼモジュレーターが特定され、左側に配置されます。リンカーは、2つのリガンドの間に水平に伸ばされて表示されます。残りの部分、ターゲティング弾頭は右向きに表示されます。
チュートリアルビデオ
Quick Start - Part 1
構造データの読み込みと骨格ツリーの構築
Quick Start - Part 2
テーブルの作成とレポートの生成
Quick Start - Part 3
グラフの作成、データの視覚化
Rグループテーブルの作成
解説ビデオ 1
MMP(Matched Molecular Pair)解析機能
解説ビデオ 2
Scaffold Hopping機能
解説ビデオ 3
画像の構造を構造式に変換して取込み
解説ビデオ 4
CDD Vault連携機能
参考文献
Building ChemBank Compound Scaffolds using SARvision Plus™
ほとんどの研究者にとってハイスループットスクリーニング(HTS)のデータ分析は今日もなお挑戦的なタスクとなっています。HTS実験に携わる研究者は、データの分析・視覚化・解釈の為に洗練された実用的なソフトウェアを求めています。これらの解決策を説明するために本レポートでは、ChemBankからのアッセイデータセットをどのようにして簡単にSARvisionSMに取込み、素早くSARテーブルを生成し、骨格を抽出し、動的なプロットが1つのデスクトップアプリケーションで行えるかを解説します。
関連製品
ペプチド・抗体・RNAなど大きな分子の配列相関解析にはSARvision Biologics
関連製品・サービス