SARvision Biologics

SARvision | Biologicsは既存のバイオロジックスソフトウエアの隙間を埋めるデスクトップアプリケーションで、ペプチドや核酸などバイオポリマーのデータを読み込み整理する為の基盤ツールと配列と活性の関連を見出す様々なツールを提供します。
配列解析に最適化されたスプレッドシートが提供され、非天然アミノ酸や化学的に修飾された残基を含む、RNA、タンパク、ペプチドといったバイオポリマーを取り扱うことが出来ます。

 

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特徴

• ペプチド、抗体、RNAに関する研究をを支援

• 非天然アミノ酸、環化、化学修飾を含むペプチドの取り扱いが可能

• ヒートマップによる活性の視覚化機能

• 興味のある領域のハイライト

• 活性に大きな影響のある変異の探索（Logo Plot、Invariant Map、Mutation Cliff）

• 配列データの読み込みとアライメント（自動および手動）

• ANARCIに基づいたナンバリングアルゴリズムを実装し抗体に自動的にナンバリング（Kabat、Chothia、Enhanced Chothia、IMGT、AHoに対応）

• 何百もの配列を検討可能

オンラインチュートリアル

クイックスタートガイド

残基と修飾子のテーブルの準備

データビュー

シーケンステーブルビューでシーケンスとデータを視覚化する方法。

Logo and Bar Plots

Logo Plotsは、ペプチドのSARの傾向や、抗体の表現型の特徴を分析するための優れたツールになります。

Invariant Maps

Invariant Mapsは、配列アラインメントの各位置でどの残基が試行されたか、およびその回数を示します。

Mutation cliffs

Mutation cliffsは、単一の位置でのみ異なる配列のペアを識別し、突然変異と配列の位置の両方でそれらを編成するために設定されます。

サブセットグループの操作

あるビューを別のビューでフィルタリングする方法。

抗体のナンバリング

抗体設計におけるデータへの配列の関連付けを容易にするためのアプリケーションノート。