JChem PostgreSQL Cartridge

豊富な機能

JChemの構造ハンドリングおよび構造検索機能は、PostgreSQLデータベースの拡張とJChem-psqlサービスにより提供されます。これは、任意の数のインデックス付きテーブル、さらにはテーブル中のカラム数も好きなだけ設定でき、マルチユーザーによる平行処理をサポートします。本製品が提供するMoleculeと呼ぶカラムタイプは、化学構造を保存するのに役に立ちます。このMoleculeタイプは、クライアント企業様のビジネスルールに従ってカスタマイズできます。カスタム化には、構造式の標準化および互変異性体のハンドリングを含みます。タイプには、一般的に用いられる様々な構造データフォーマットが使えます。（SMILES、v2000およびv3000のMDL molfile、MDL SDF、RXN、RDF、MRV、IUPAC名、InChI）。

化学インデックスとファイルインポート

 JChem PostgreSQL Cartridgeは、Moleculeタイプ以外にも、分子の検索をスピードアップするために特別なインデックスタイプ（chemindex）を提供します。インデックスは、すべてのデータオペレーションに伴い自動的に更新されます。Molecule列における化学検索機能は、複雑なデータマイニングを可能にするSQLにシームレスに統合されています。SDファイルのインポートツールも提供されます。また、PostgreSQLビルトイン機能を使用して、SMILESまたはInChIファイルのような線形表記法をインポートすることができます。これを用いると1つのSQL文でテーブル全体をインポートできます。

本製品でサポートしている検索タイプ

• 部分構造

• フルフラグメント足り

• 重複

• スーパーストラクチャー

• 谷本メトリックスによる類似性検索

信頼のおけるフリーデータベース管理システムで化学構造管理を実現

 PostgreSQLは、過去10年においてその特別な信頼性と広い有効性によって高く評価されています。その重要な利点は、システムを保有するためのトータルコストの低さです。自由度が高く、そのメンテナンスとオペレーションは大部分の他の業界標準ソリューションより非常に簡単且つ低コストです。

JChem PostgreSQL Cartridgeは、すべてのデータベース管理がわずか一人のユーザー本人によって行われているようなシングルユーザー・シングルホストセットアップから、企業レベルのソリューション（クラスターコンピュータ上で動かし、複数拠点からアクセスするようなグローバル企業のデータウェアハウスのバックエンドとして）に至るまで、幅広い用途に対応が可能です。そのスケーラビリティは、シングルユーザーの時と同じコストで、多数の並列ユーザーにサービスを提供することができるので、とくにウェブサーバーのデータ・バックエンドに適しています。