JChem Base
構造検索エンジン
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高速かつ高度な構造/反応検索をサポート
JChem Baseは高速な検索アルゴリズムを搭載し、完全一致検索、部分構造検索、類似構造検索、スーパーストラクチャー検索、反応検索、マーカッシュ(Markush)構造のハンドリングをサポートしています。
また、これらの検索時には次のような複雑なクエリーを用いることができます。- SMARTSのサポート
- アトムリスト、ノットリスト、スーパーアトム
- チャージ、アイソトープ、ラジカル
- 水素数、芳香族/脂肪族原子
- リングサイズ、コネクティビティー ボンドタイプ、リング/チェイン
- Rグループ
- ステレオケミストリー
様々なリレーショナルデータベースをサポート
JChem BaseはOracleをはじめ、SQL Server、MySQL、DB2、PostgreSQLなどをサポートしており、使用目的に合わせて最適なリレーショナルデータベース管理システムを選択できます。
Jchem BaseはGUI管理ツールを提供しており、データベース管理者は容易にテーブルの作成、構造データのインポート/エクスポートができます。開発効率の高いAPIを提供
JChem BaseはJavaおよび.NET(JNBridge経由)対応の使い易いAPIを提供しております。構造検索や表示、化学的なデータのハンドリングをスムーズに行うことが出来ます。特にWebアプリケーションの開発のし易さで定評があります。様々なクライアントからアクセスが可能
デスクトップ製品のInstantJChemをはじめWebアプリケーションやEXCEL,Spotfire,SciTegic PipelinePilotなどのサードパーティーアプリケーションからアクセスが可能です。化学的パラメータの組み合わせ(ケミカルターム)による検索
ケミカルタームとはChemAxonが考案した化学的ルールを記述するための言語で、化合物の物理化学的パラメータなどを複数組み合わせて、検索や条件設定に用いる事ができます。JChem Baseでは、例えば、「任意の部分構造をもつリードライクな化合物」あるいは、「ある構造に類似したバイオアバイラビリティーの優れた化合物」といった 条件で検索が行えるようになります。ケミカールタームで用いるパラメータは、検索実行時にオンザフライで計算されます。予め計算したプロパティーをデータ ベースに格納する必要はありません。(本機能のご利用にはCalculator Pluginが必要です。)hemistry Infrastructure Migration in Global Pharmaceutical Company: Concerns and Reality
September 2012 Author: Zhenbin Li (Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals Inc.)関連リンク(英文)
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