JChem Base

構造検索エンジン

開発ツールキット

高速かつ高度な構造/反応検索をサポート

JChem-Base

JChem Baseは高速な検索アルゴリズムを搭載し、完全一致検索、部分構造検索、類似構造検索、スーパーストラクチャー検索、反応検索、マーカッシュ(Markush)構造のハンドリングをサポートしています。
また、これらの検索時には次のような複雑なクエリーを用いることができます。

 

 

 

  • SMARTSのサポート

  • アトムリスト、ノットリスト、スーパーアトム

  • チャージ、アイソトープ、ラジカル

  • 水素数、芳香族/脂肪族原子

  • リングサイズ、コネクティビティー ボンドタイプ、リング/チェイン

  • Rグループ

  • ステレオケミストリー

 

 

様々なリレーショナルデータベースをサポート

JChem BaseはOracleをはじめ、SQL Server、MySQL、DB2、PostgreSQLなどをサポートしており、使用目的に合わせて最適なリレーショナルデータベース管理システムを選択できます。
Jchem BaseはGUI管理ツールを提供しており、データベース管理者は容易にテーブルの作成、構造データのインポート/エクスポートができます。

 

開発効率の高いAPIを提供

JChem BaseはJavaおよび.NET(JNBridge経由)対応の使い易いAPIを提供しております。構造検索や表示、化学的なデータのハンドリングをスムーズに行うことが出来ます。特にWebアプリケーションの開発のし易さで定評があります。

 

様々なクライアントからアクセスが可能

デスクトップ製品のInstantJChemをはじめWebアプリケーションやEXCEL,Spotfire,SciTegic PipelinePilotなどのサードパーティーアプリケーションからアクセスが可能です。

 

化学的パラメータの組み合わせ(ケミカルターム)による検索

ケミカルタームとはChemAxonが考案した化学的ルールを記述するための言語で、化合物の物理化学的パラメータなどを複数組み合わせて、検索や条件設定に用いる事ができます。JChem Baseでは、例えば、「任意の部分構造をもつリードライクな化合物」あるいは、「ある構造に類似したバイオアバイラビリティーの優れた化合物」といった 条件で検索が行えるようになります。ケミカールタームで用いるパラメータは、検索実行時にオンザフライで計算されます。予め計算したプロパティーをデータ ベースに格納する必要はありません。(本機能のご利用にはCalculator Pluginが必要です。)

 

 

hemistry Infrastructure Migration in Global Pharmaceutical Company: Concerns and Reality

September 2012 Author: Zhenbin Li (Boehringer Ingelheim Pharmaceuticals Inc.) 

 

 

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